目次

• はじめてのけいとうじゅ　 [PDF]
• はじめてのけいとうじゅミニ（2 ページ要約版） [PDF]
• SeaView を用いたアラインメント編集　 [PDF]
• SeaView を用いたアラインメント編集ミニ（1 ページ要約版） [PDF]
• Bayes 法による系統解析
• Bayes 法（ベイズ法）の原理　 [PDF]
• MrBayes 3.1.2 を用いた系統解析　 [PDF]
• （MrBayes 3.1.1 を用いた系統解析）
• （MrBayes 3.0b4 を用いた系統解析）
• ベイズブロックのダウンロード
• mcmcA.bay
  （解析時間の目安に用いる。10,000 世代解析し、100 世代ごとにサンプリング。 2 runs、各 4 chains。生成するファイル名は Gene1.**）
• mcmcB.bay
  （解析に用いる。2 つの run の標準偏差が 0.01 を切った時に自動的に終了。 標準偏差の計測は 500,000 世代ごと。100 世代ごとにサンプリング。2 runs、各 4 chains。 生成するファイル名は Gene1.**）
• mcmcC.bay
  （解析に用いる。1,000,000 世代解析し、100 世代ごとにサンプリング。2 runs、各 4 chains。 生成するファイル名は Gene1.**）
• MrModeltest 用のバッチファイル
• mrmod.bat
  （mrmodeltest2.exe の使用に用いる。同じフォルダにある mrmodel.scores を読み込ませて， MrMod.out を生成する）
• 系統樹の用語
• 単系統，側系統，多系統　 [PDF]
• 系統解析の参考書