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Bayes 法による系統解析
作成:仲田崇志
更新:2006年09月19日
目次
Bayes 法(ベイズ法)の原理
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MrBayes 3.1.2 を用いた系統解析
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(MrBayes 3.1.1 を用いた系統解析)
(MrBayes 3.0b4 を用いた系統解析)
ベイズブロックのダウンロード
mcmcA.bay
(解析時間の目安に用いる。10,000 世代解析し、100 世代ごとにサンプリング。2 runs、各 4 chains。 生成するファイル名は Gene1.**)
mcmcB.bay
(解析に用いる。2 つの run の標準偏差が 0.01 を切った時に自動的に終了。標準偏差の計測は 500,000 世代ごと。 100 世代ごとにサンプリング。2 runs、各 4 chains。生成するファイル名は Gene1.**)
mcmcC.bay
(解析に用いる。1,000,000 世代解析し、100 世代ごとにサンプリング。2 runs、各 4 chains。生成するファイル名は Gene1.**)
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